An imaging biomarker of tumor-infiltrating lymphocytes to risk-stratify patients with HPV-associated oropharyngeal cancer

BACKGROUND: Human papillomavirus (HPV)-associated oropharyngeal squamous cell carcinoma (OPSCC) has excellent control rates compared to nonvirally associated OPSCC. Multiple trials are actively testing whether de-escalation of treatment intensity for these patients can maintain oncologic equipoise while reducing treatment-related toxicity. We have developed OP-TIL, a biomarker that characterizes the spatial interplay between tumor-infiltrating lymphocytes (TILs) and surrounding cells in histology images. Herein, we sought to test whether OP-TIL can segregate stage I HPV-associated OPSCC patients into low-risk and high-risk groups and aid in patient selection for de-escalation clinical trials. METHODS: Association between OP-TIL and patient outcome was explored on whole slide hematoxylin and eosin images from 439 stage I HPV-associated OPSCC patients across 6 institutional cohorts. One institutional cohort (n = 94) was used to identify the most prognostic features and train a Cox regression model to predict risk of recurrence and death. Survival analysis was used to validate the algorithm as a biomarker of recurrence or death in the remaining 5 cohorts (n = 345). All statistical tests were 2-sided. RESULTS: OP-TIL separated stage I HPV-associated OPSCC patients with 30 or less pack-year smoking history into low-risk (2-year disease-free survival [DFS] = 94.2%; 5-year DFS = 88.4%) and high-risk (2-year DFS = 82.5%; 5-year DFS = 74.2%) groups (hazard ratio = 2.56, 95% confidence interval = 1.52 to 4.32; P \u3c .001), even after adjusting for age, smoking status, T and N classification, and treatment modality on multivariate analysis for DFS (hazard ratio = 2.27, 95% confidence interval = 1.32 to 3.94; P = .003). CONCLUSIONS: OP-TIL can identify stage I HPV-associated OPSCC patients likely to be poor candidates for treatment de-escalation. Following validation on previously completed multi-institutional clinical trials, OP-TIL has the potential to be a biomarker, beyond clinical stage and HPV status, that can be used clinically to optimize patient selection for de-escalation

¿Por qué no aprendemos de los indígenas el manejo apropiado de los recursos naturales?

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Experiencia pedagógica: reconocimiento y apropiación de problemas ambientales a través del lema

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Efficient interaction with large medical imaging databases

Everyday, a wide quantity of hospitals and medical centers around the world are producing large amounts of imaging content to support clinical decisions, medical research, and education. With the current trend towards Evidence-based medicine, there is an increasing need of strategies that allow pathologists to properly interact with the valuable information such imaging repositories host and extract relevant content for supporting decision making. Unfortunately, current systems are very limited at providing access to content and extracting information from it because of different semantic and computational challenges. This thesis presents a whole pipeline, comprising 3 building blocks, that aims to to improve the way pathologists and systems interact. The first building block consists in an adaptable strategy oriented to ease the access and visualization of histopathology imaging content. The second block explores the extraction of relevant information from such imaging content by exploiting low- and mid-level information obtained from from morphology and architecture of cell nuclei. The third block aims to integrate high-level information from the expert in the process of identifying relevant information in the imaging content. This final block not only attempts to deal with the semantic gap but also to present an alternative to manual annotation, a time consuming and prone-to-error task. Different experiments were carried out and demonstrated that the introduced pipeline not only allows pathologist to navigate and visualize images but also to extract diagnostic and prognostic information that potentially could support clinical decisions.Resumen: Diariamente, gran cantidad de hospitales y centros médicos de todo el mundo producen grandes cantidades de imágenes diagnósticas para respaldar decisiones clínicas y apoyar labores de investigación y educación. Con la tendencia actual hacia la medicina basada en evidencia, existe una creciente necesidad de estrategias que permitan a los médicos patólogos interactuar adecuadamente con la información que albergan dichos repositorios de imágenes y extraer contenido relevante que pueda ser empleado para respaldar la toma de decisiones. Desafortunadamente, los sistemas actuales son muy limitados en cuanto al acceso y extracción de contenido de las imágenes debido a diferentes desafíos semánticos y computacionales. Esta tesis presenta un marco de trabajo completo para patología, el cual se compone de 3 bloques y tiene como objetivo mejorar la forma en que interactúan los patólogos y los sistemas. El primer bloque de construcción consiste en una estrategia adaptable orientada a facilitar el acceso y la visualización del contenido de imágenes histopatológicas. El segundo bloque explora la extracción de información relevante de las imágenes mediante la explotación de información de características visuales y estructurales de la morfología y la arquitectura de los núcleos celulares. El tercer bloque apunta a integrar información de alto nivel del experto en el proceso de identificación de información relevante en las imágenes. Este bloque final no solo intenta lidiar con la brecha semántica, sino que también presenta una alternativa a la anotación manual, una tarea que demanda mucho tiempo y es propensa a errores. Se llevaron a cabo diferentes experimentos que demostraron que el marco de trabajo presentado no solo permite que el patólogo navegue y visualice imágenes, sino que también extraiga información de diagnóstico y pronóstico que potencialmente podría respaldar decisiones clínicas.Doctorad

Proyectos ambientales escolares. Estrategia para la formación ambiental

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Presentación

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¿A quién corresponde la educación ambiental?

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Desarrollo sostenible

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AUTO DE LOS REYES MAGOS O LA ESTÉTICA DE LA MANIFESTACIÓN

Este trabajo muestra la apertura y dispersión textual del Auto de losReyes Magos, así como la estructuración dinámica del texto.El análisis recorre el texto paso a paso en una sutil travesía por el tejido verbal delos personajes del Auto de los Reyes Magos

Diversidad florística en un paisaje rural del piedemonte de los Farallones de Cali, Colombia

This study aimed to evaluate composition, structure and plant diversity of forest, scrub and grassland in a rural landscape of the piedmont of the “Farallones of Cali” in 2013. We sampled three replicates of forest and scrub which consisted of a total of 24 plots of 200 m2 to register trees, and 24 subplots of 50 m2 to register shrubs and seedlings. In grassland, 36 quadrants of 1 m2 were sampled. In total, 140 species were recorded (69 in forest, 60 in scrub and 53 in grassland). Families with the highest importance value were Melastomataceae, Myrtaceae and Lacistemataceae in forest, Melastomataceae in scrub and Poaceae and Asteraceae in grassland. In conclusion, the plant community is in early successional stages, dominated by intermediate pioneer species and rich in seedlings plants.El objetivo de esta investigación fue evaluar la composición, estructura y diversidad florística de bosque, matorral y pastizal en un paisaje rural del piedemonte de los Farallones de Cali en el año 2013. Se realizaron muestreos con tres repeticiones en cada elemento del paisaje. En bosque y matorral se muestrearon en 24 parcelas en total de 200 m2 para registrar árboles, y 24 subparcelas de 50 m2 para registrar arbustos y plántulas. En pastizales, se muestrearon 36 cuadrantes de 1 m2. En total, se encontraron 140 especies (69 en bosque, 60 en matorral y 53 en pastizal). Las familias con mayor índice de importancia fueron: en bosque Melastomataceae, Myrtaceae y Lacistemataceae; en matorral, Melastomataceae; y en pastizal, Poaceae y Asteraceae. El elemento del paisaje más diverso fue matorral. Se concluye que la comunidad vegetal se encuentra en estados sucesionales tempranos, dominada por plantas pioneras intermedias y ricas en plántulas